Monitoring kvaliteta vode vodotoka u mreži izveštajnih stanica: Dunav (Novi Sad), Sava (Jamena), Velika Morava (Bagrdan i Ljubičevski Most) i Ibar (Raška) sprovodi se sa dnevnom dinamikom ispitivanja. Fizičko-hemijske analize uzoraka uzorkovanih u 7:00 (odnosno 8:00) časova po lokalnom vremenu, obuhvataju određivanje 19 parametara: boja, miris, vidljive otpadne materije (v.o.m.), temperatura vode, elektroprovodljivost (e.p.), pH, rastvoreni kiseonik (O₂), procenat zasićenja vode kiseonikom, hemijska potrošnja kiseonika (HPK_Mn), biološka potrošnja kiseonika (BPK-5), amonijum jon (NH₄-N), nitriti (NO₂-N), nitrati (NO₃-N), rastvoreni ugljen dioksid (CO₂), karbonati (CO₃), bikarbonati (HCO₃), ukupni alkalitet(CaCO₃) i fenolni indeks.